中国热带农业科学院农产品加工研究所源于1954年在广州创立的“华南热带林业科学研究所”的化工部。1964年该化工部搬迁至广东省湛江市，并正式成立“华南热带作物产品加工设计研究所”，2003年更为现名。本所是隶属于农业农村部的副局级科研事业单位，设立办公室、科技处、人事处、财务处、成果转化处、基地与条件建设处6个处室，设立天然橡胶加工、食品科学、农产品质量与安全、农业纳米科学4个学科。现有人员编制435人，在编在岗人员190人，拥有中高级专业技术人员84人，博士、硕士学位科技人员75人，博士后6人。承建国家、省、部级科技平台16个，拥有科研仪器设备原值近1.2亿元。先后获科技成果180多项，获国家和省部级科技奖励近60项，其中近几年获国家科技进步二等奖2项，是我国热带农产品加工科技进步的重要支撑平台。